Вологодская область, Кадуйский район. Состоит из шести отдельных территорий, административно объединённых в три участка — Заяцкий, Кадуйский и Уйтинский. Расположен в долине реки Суда и предназначен для охраны боровых сосняков.
Вологодская область, Череповецкий район; Ярославская область, Брейтовский район. Расположен в сохранившейся от затопления части Молого-Шекснинской низменности, включает в себя также часть акватории Рыбинского водохранилища.